NÃO RECOMENDADO!

Terminal:

ng new my-project --style=scss
cd my-project
npm install --save [email protected]
ng serve

Em src/styles.scss, adicionar:

@import '~bootstrap/dist/css/bootstrap.min.css';

Em src/app/app.module.ts:

declare var jquery: any;
declare var $: any;

Em angular-cli.json:

...
"scripts": [
  "../node_modules/jquery/dist/jquery.js",
  "../node_modules/tether/dist/js/tether.js",
  "../node_modules/bootstrap/dist/js/bootstrap.js"
],
...